Este equipo ha estado 68 temporadas en la Primera división, y 6 en la Segunda división. El filial del primer equipo de fúbol es el Club Atlético de Madrid B, fundado en 1963 y que actualmente juega en el Grupo I de Segunda división B. Este equipo ha pasado 11 temporadas en la Segunda división (donde debutó en la temporada 1980-81), 17 en la Segunda división B, y 10 en la Tercera división.